O sistema universitário da Região Emilia-Romagna é composto por 6 universidades com mais de 400 cursos de laurea trienal e maestral (5 anos), 153 mestrados, 126 cursos de especialização, 113 doutorados e 150 mil alunos matriculados (anos de. 2015-16).
As universidades existentes na Emilia-Romagna são a seguintes: a Universidade de Bolonha (entre as mais antigas do mundo ocidental) com campus em Cesena, Forlì, Ravenna e Rimini, a Universidade de Modena e Reggio Emilia, a Universidade de Ferrara, a Universidade de Parma, a Universidade Católica de Piacenza, a sede de Piacenza do Politecnico de Milano e, além disso, acrescenta-se a americana Johns Hopkins.